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タイトル
  • ヒト ABC 輸送体 ABCB1 の基質輸送に関わるアミノ酸残基の in silico 予測
その他のタイトル
  • In silico prediction of amino acid residues involved in substrate transport by the human ABC transporter ABCB1.
作成者
    • 佐竹, 一紘
    • 三谷, 勇仁
    • 中村, 一郎
    • 今井, 律子
    • Efferth,, Thomas
    • 中川, 大
主題
  • Other ABC transporter, ABCB1, P-glycoprotein, Docking study
内容注記
  • Other type:報文
  • Other 患者の3分の1が現役世代であり日本人最多の死因である「 がん」の化学療法において,「がん細胞の薬剤耐性」が長年問題になっている. 高齢化が進行する我が国において健やかな高齢社会を実現するためには,高齢者の健康維持に加えて「現役世代の健康維持」も不可欠である.本研究では,がん細胞に薬剤耐性を付与する代表的な因子の1つ「 ABC 輸送体 ABCB1」に注目し, ABCB1 の基質輸送に強く関わるアミノ酸残基の予測を試みた.マウス Abcb1a の X 線結晶構造データ( PDB code : 3G60)を基にヒトABCB1 のホモロジーモデルを構築し ,基質化合物とのドッキングスタディを実施した結果,Phe303, Tyr307, Ala342, Phe343 が ABCB1によ る化合物の捕捉に高頻度で利用され,Ala342, Phe343 が ABCB1の基質輸送に関与するアミノ酸残基であると予測した.
  • Other Cancer is the most common cause of death in Japan, and one-third of patients are of working age. It is essential to maintain the health of the working-age population and the elderly to realize a healthy aging society in Japan. Drug resistance of cancer cells has been a barrier to successful chemotherapy for cancer for a long time. In the present study, we focused on the ABC transporter ABCB1, one of the representative factors that conferred drug resistance to cancer cells. A homology model of human ABCB1 was constructed based on the X-ray crystal structure data of mouse Abcb1a (PDB code: 3G60), and docking studies was performed to predict amino acid residues intensely involved in substrate recognition by ABCB1. The present study indicated a possibility that Phe303, Tyr307, Ala342, and Phe343 are highly utilized in the capture of compounds by ABCB1 and that Ala342 and Phe343 are amino acid residues involved in substrate transport by ABCB1.
出版者 中部大学生物機能開発研究所
日付
    Created2023-09-29 , Issued2023-09
言語
  • jpn
資源タイプ departmental bulletin paper
出版タイプ VoR
資源識別子 URI http://elib.bliss.chubu.ac.jp/webopac/XC23000055
収録誌情報
    • ISSN 1880-7941
      • 生物機能開発研究所紀要
      • 巻23 開始ページ12 終了ページ20
ファイル
コンテンツ更新日時 2023-10-07